Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pot1bH7BX60 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms