Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms