Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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