Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms