Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms