Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms