Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms