Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms