Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms