Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ScaperF8VQ70 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms