Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms