Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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