Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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