Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms