Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8444F6XS56 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms