Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21974F6W3F3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms