Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms