Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1bF6V0H0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pagr1bF6V0H0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms