Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm17555F6U8B9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm17555F6U8B9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm17555F6U8B9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm17555F6U8B9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm17555F6U8B9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm17555F6U8B9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm17555F6U8B9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm17555F6U8B9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm17555F6U8B9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm17555F6U8B9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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