Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmod3E9QA62 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms