Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp17lbE9Q9U0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Usp17lbE9Q9U0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Usp17lbE9Q9U0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Usp17lbE9Q9U0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Usp17lbE9Q9U0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp17lbE9Q9U0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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