Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms