Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col22a1E9Q7P1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col22a1E9Q7P1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms