Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms