Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D8

C6, Complement component 6, mousemouse

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Length 931 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6E9Q6D8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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C6E9Q6D8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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C6E9Q6D8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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C6E9Q6D8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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C6E9Q6D8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C6E9Q6D8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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C6E9Q6D8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6E9Q6D8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms