Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2237E9Q501 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms