Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930546C10RikE9Q4Y3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930546C10RikE9Q4Y3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms