Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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