Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt78E9Q0F0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms