Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3095E9Q058 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms