Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc1E9Q043 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms