Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx60E9PZQ1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ddx60E9PZQ1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms