Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms