Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc8E9PWG2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms