Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc17E9PVB5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc17E9PVB5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms