Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan18E9PUD6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan18E9PUD6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan18E9PUD6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan18E9PUD6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan18E9PUD6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan18E9PUD6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zscan18E9PUD6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms