Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cngb1E1AZ71 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms