Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms