Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5930D3Z257 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5930D3Z257 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms