Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc6D3YZP9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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