Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6685D3YYP3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms