Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf217D3YYI7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms