Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms