Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm4950D3YUM8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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