Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms