Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip3B9EHT4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms