Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrr3B2RXA8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169 ms