Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms