Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Otud7bB2RUR8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms