Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms